真菌核酸三联检测——精准助力真菌感染早期诊断

发布时间:2024-07-30 作者: 医学界呼吸频道 浏览:1

一、肺部真菌病是什么?


侵袭性真菌病(invasive fungal disease,IFD)系指真菌侵入人体,在组织、器官或血液中生长、繁殖,并导致炎症反应及组织损伤的感染性疾病。真菌通常由呼吸道定植或吸入真菌孢子进入人体,因此肺部染是高发部位,肺部致病性真菌感染已导致侵袭性真菌病的发病率和死亡率急剧增加,尤其是在宿主免疫应答严重缺陷患者中。部分肺部真菌感染临床表现无特异性,早期诊断困难,病情易被原发病掩盖,易造成误诊、漏诊、过度用药。


在我国,常见的肺真菌病感染病原体包括曲霉、隐球菌、孢子菌、毛霉菌等[1]


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曲霉菌


曲霉菌在室内和室外环境中非常常见,并且经常出现在堆肥堆、通风口和空气传播的灰尘中。因此,这些真菌是不可避免的。通常曲霉病是由吸入曲霉菌孢子引起的。大多数人每天吸入这些孢子,而不会受到影响。但是,如果免疫系统薄弱,感染的可能性更大。


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图1 曲霉菌感染


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新型隐球菌


新型隐球菌又名溶组织酵母菌,是土壤,鸽类,牛乳、水果等的腐生菌,也可存在人口腔中,可侵犯人和动物,一般为外源性感染,但也可能为内源性感染,对人类而言,它通常是条件致病菌。本菌大多由呼吸道转入,在肺部引起轻度炎症,或隐性传染。亦可由破损皮肤及肠道传入。当机体免疫功能下降时可向全身播散,主要侵犯中枢神经系统,发生真菌性脑膜炎、脑炎、脑肉芽肿等,此外可侵入骨骼、肌肉、淋巴结、皮肤粘膜引起慢性炎症和脓肿[2-5]


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图2 新型隐球菌感染


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肺孢子菌


肺孢子菌是免疫受损患者肺炎的常见病因,尤其是人免疫缺陷病毒(HIV)感染者和接受全身糖皮质激素治疗的患者。症状包括发热、呼吸困难和干咳。诊断需在诱导痰或支气管刷检标本中找到病原体。肺孢子菌在环境中普遍存在,且通过气溶胶传播,对免疫功能正常者不致病。然而,以下患者存在肺孢子菌肺炎风险:HIV感染且CD4+T淋巴细胞计数<200/mcL的患者、器官移植受者、血液系统恶性肿瘤患者、服用糖皮质激素的患者或其他免疫抑制药物[6-7]


多数病人表现为发热、呼吸困难和干咳,呈持续数周的亚急性病程(HIV感染者)或持续数天的急性病程(其他原因导致的细胞免疫功能受损者)。呼吸困难常见。


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图3 肺孢子菌感染


二、实验室检测方法有哪些?


肺部真菌感染的诊断项目包括影像学、组织病理学和微生物学等。



影像学:不同致病菌在影像学上会有相对特异性的形态特征,可直观的明确病灶的形态学特征,但敏感性不高,存在异病同影,鉴别困难,需要实验室确诊。


组织病理学:组织活检,病灶部位取样,对局部组织细胞进行化验,有创操作,存在风险。


微生物学:涂片与培养、血清学检测、分子检测方法是目前主要的微生物学检测方法。



传统的实验室真菌检测方法主要是培养与镜检,真菌培养对于诊断感染以及确认致病真菌种类有重要价值,但存在耗时较长、阳性率低、部分病原体难以培养或鉴定等问题,例如耶氏肺孢子菌难以培养。而镜检依赖人员经验,灵敏度低,漏诊率高。不同血清学方法的临床意义及适用真菌感染种类不同,在不同高危人群中应用价值也有差异,结果的影响因素多,可造成假阳性或假阴性。PCR方法具有灵敏度高、特异性强、无窗口期的特点,能在较短的时间内检测到含量很低的真菌DNA,有利于真菌感染的早期诊断。对曲霉、肺孢子菌和新型隐球菌检测有良好应用前景,是真菌检测的有效手段之一,可以弥补传统真菌检测方法的不足,覆盖临床常见肺部致病真菌菌属,能够给临床医生提供准确的检测结果,尽早帮助临床医生明确病原体类型,有利于精准用药[6]


表1 各指南/共识对PCR方法的建议或表述

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三、临床意义


1、帮助患者精准检出三种常见肺侵袭性真菌感染致病真菌病原体,包括曲霉菌属、新型隐球菌及耶氏肺孢子菌,能够给临床医生提供准确的检测结果。


2、采用PCR荧光探针法,窗口期短,灵敏度高、特异性强,结果准确可靠,尽早帮助临床医生明确病原体类型,有利于精准用药。


3、充分考虑定植和致病菌区分,更真实反应患者真菌感染情况。


4、填补在真菌分子检测项目上的空白,与传统检测方法联合使用可提高特异性[13-15]


5、覆盖科室广泛,帮助医生进行病情判断和评估,提升科室诊疗水平。


四、结果判读


表2 检测项目与结果判读

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五、注意事项


痰液留取要求:


留取晨痰,先用淡盐水或清水漱口,装有义齿的患者应先将义齿取出,深呼吸2-3次,用力从肺部深处咳出痰液,将咳出的痰液留置在痰盒中(3-5毫升),并拧紧痰盒盖。


排痰不畅或无痰时,可给予叩背帮助排痰,必要时予雾化吸入后再排痰。


参考文献

[1]刘又宁, 佘丹阳, 孙铁英, 等. 中国 1998 年至 2007 年临床确诊的肺真菌病患者的多中心回顾性调查 [J]. 中华结核和呼吸杂志, 2011, 34(2):86-90.
[2]刘正印, 李若瑜, 张文宏, et al. 隐球菌性脑膜炎诊治专家共识[J]. 中华内科杂志, 2018, 57(5):7.
[3]Kwon-Chung KJ, et al. Cold Spring Harb Perspect Med. 2014 Jul 1;4(7):a019760.
[4]Denham ST, Brown JCS. J Fungi (Basel). 2018 Feb 17;4(1). pii: E25.    
[5]张梦,常静侠,张冰璐,等.非HIV感染免疫抑制合并肺孢子菌肺炎患者预后分析[J].中国感染与化疗杂志,2023,23(5):539-543.DOI:10.16718/j.1009-7708.2023.05.001.
[6]东昉.欧洲癌症研究和治疗组织(EORTC)及真菌研究组教育与研究共同体(MSGERC)关于侵袭性真菌病定义共识的修订及更新[J].中国感染与化疗杂志,2021,21(04):495-500.
[7]J Peter Donnelly, Sharon C Chen, Carol A Kauffman, et al. Revision and Update of the Consensus Definitions of Invasive Fungal Disease From the European Organization for Research and Treatment of Cancer and the Mycoses Study Group Education and Research Consortium. Clin Infect Dis. 2020,71(6):1367-1376.
[8][5]Chadi A Hage, Eva M Carmona, Oleg Epelbaum,et al. Microbiological Laboratory Testing in the Diagnosis of Fungal Infections in Pulmonary and Critical Care Practice. An Official American Thoracic Society Clinical Practice Guideline. Am J Respir Crit Care Med 2019,200(5):535-550.
[9]血液病/恶性肿瘤患者侵袭性真菌病的诊断标准与治疗原则(第六次修订版). 中华内科杂志,2020,59(10):754-762.
[10]侵袭性真菌病实验室诊断方法临床应用专家共识. 中华内科杂志,2022,61(2):134-141.
[11]侵袭性真菌病真菌学检查指南. 中华检验医学杂志,2023,46(6):541-557.
[12]重症新型冠状病毒感染合并侵袭性肺曲霉病和肺毛霉病诊治专家共识. 中华结核和呼吸杂志, 2024,47(1):10-23.
[13]Yan G, Chew K L, Chai L Y A. Update on non-culture-based diagnostics for invasive fungal disease[J]. Mycopathologia, 2021, 186(5): 575-582.
[14]P Lewis White, et al. Clin Infect Dis. 2021,72(Suppl 2):S95-S101
[15]P Lewis White , Stephane Bretagne , Angela M Caliendo, et al. Aspergillus Polymerase Chain Reaction-An Update on Technical Recommendations, Clinical Applications, and Justification for Inclusion in the Second Revision of the EORTC/MSGERC Definitions of Invasive Fungal Disease. Clin Infect Dis. 2021 Mar 12;72(Suppl 2):S95-S101.